Selain enam agama besar di Indonesia, Kota Balikpapan mencatatkan penganut agama lain. Penganut agama lain ini per 31 Desember 2023 tercatat 12 jiwa. Dibandingkan dengan tahun sebelumnya, jumlah penduduk memeluk agama lainnya di kabupaten/kota berkurang 3 jiwa
Menurut data Ditjen Dukcapil Kemendagri, porsi penduduk beragama lainnya di kabupaten/kota ini mencapai 0,00161 persen dari total penduduk pada 2024 lalu berjumlah 746,8 ribu jiwa.
(Baca: Prevalensi Ketidakcukupan Konsumsi Pangan di Kutai Barat Turun 3,76% Setahun Terakhir)
Jika dilihat dari sebarannya terhadap jumlah penduduk masing-masing daerah di Kalimantan Timur, proporsi penduduk beragama lainnya di Kota Balikpapan ini ada di urutan lima.
Adapun kabupaten/kota lain di Kalimantan Timur, penduduk yang memeluk selain enam agama besar dari urutan yang terbanyak yakni Kabupaten Kutai Barat 99 jiwa, Kabupaten Kutai Kartanegara 74 jiwa, Kota Samarinda 57 jiwa, Kabupaten Kutai Timur 23 jiwa, Kabupaten Berau 9 jiwa, Kabupaten Paser 4 jiwa, Kabupaten Mahakam Hulu 3 jiwa, Kabupaten Penajam Paser Utara 1 jiwa dan Kota Bontang 0 jiwa.
(Baca: 0,01% Penduduk di Kabupaten Lebong Beragama Hindu)