Pematang Siantar, Salatiga, Singkawang, Manado, dan Tual menjadi kota dengan tingkat toleransi tertinggi di Indonesia. Indeks Kota Toleran 2015 yang dirilis oleh Setara Institute menyebutkan kelima kota tersebut mendapatkan skor 1,47. Penilaian indeks ini berada pada rentang 1 hingga 7 dengan skor 1 untuk nilai paling toleran dan 7 untuk nilai paling intoleran.
Kota paling toleran berikutnya adalah Sibolga, Ambon, Sorong, Pontianak, dan Palangkaraya. Kelima kota itu mendapat nilai 1,58. Indeks ini disusun berdasarkan empat variabel, yaitu regulasi pemerintah, tindakan pemerintah, regulasi sosial, dan demografi agama.
Setara Institute menyebutkan riset ini bertujuan mempromosikan kota-kota yang dianggap berhasil mengembangkan toleransi di Indonesia. Diharapkan melalui laporan inii menjadi pemicu bagi kota-kota lain untuk mengembangkan sikap toleransi.